W latach 1754 – 57, 1759 – 63, gdy przełożonym w Kalwarii był O. Jan Kapistran Połaniecki, odrestaurowano kaplicę Grobu Matki Bożej, nad którą, w górnym kościele, postawiono nowy ołtarz.
W latach 1793 – 1816, 1819 – 22, gdy gwardianem był O. Gaudenty Tynel, położono w nawie posadzkę marmurową i wykonano marmurowe schody do kościoła górnego oraz sprawiono nowe organy.