Parafia w Chojnicy należy do najstarszych w rejonie Poznania - w dokumentach wymieniana jest już w 1374 r. W 1507 do parafii przyłączono Morasko (wówczas osobna wieś - Morawsko). W latach 1531-56 wzniesiono murowany kościół w stylu gotyckim, którego ruiny pozostały do dziś. Kościół remontowano w 1891. Jego obecny stan jest wynikiem powojennego włączenia wsi w skład poligonu i wykorzystywania budynku jako celu artyleryjskiego. Po wojnie siedzibę parafii przeniesiono do Moraska (obecnie dzielnicy Poznania).