W przeciwieństwie do bociana białego, bocian czarny gnieździ się z dala od człowieka. Na nizinach typowym dla niego środowiskiem są rozległe, wilgotne lasy w pobliżu bagien lub zbiorników wodnych. Najchętniej wybiera podmokłe lasy olszowe (olsy), w których długo stagnuje woda. W przypadku braku optymalnych środowisk gnieździ się w grądach i innych lasach liściastych a nawet w borach. W ostatnich latach zanotowano przypadki gniazdowania w niewielkich lasach (50 – 60 ha), a nawet w śródpolnych zadrzewieniach. Zdarza się też gniazdowanie w niewielkiej odległości od ruchliwych dróg lub zabudowań. Gniazdo bociana czarnego ma ponad 1 m średnicy. Najczęściej umieszczane jest w dolnej części korony starego drzewa (dębu, sosny, olszy), na grubej, poziomej gałęzi lub w rozwidleniu pnia. Mimo, ze zasięg geograficzny bociana czarnego jest znacznie większy niż bociana białego, jego liczebność jest kilkadziesiąt razy mniejsza. Szacuje się, że w Europie (bez Rosji) gnieździ się około 6.000 par bocianów czarnych. Najliczniejsze populacje zasiedlają Białoruś, Łotwę i Polskę (po ponad 1.000 par). Po 200 do 400 par zamieszkuje Słowację, Litwę, Ukrainę, Chorwację, Czechy, Hiszpanię i Węgry. Pozostałe kraje europejskie zasiedla około 700 par. Dane dotyczące występowania bociana czarnego w Rosji i Turcji są bardzo nieprecyzyjne – od 1.000 do 10.000 par w Rosji i od 500 do 2.000 w Turcji.
https://www.bocian.org.pl/bocian-czarny/o-bocianie