Konstrukcję akwarium zaprojektował architekt urodzony w Genui Renzo Piano, a wnętrze Peter Chermayeff. Nowoczesna budowla zintegrowana jest z prawdziwym statkiem (Grande Nave Blu, Duży Niebieski Statek), w którego wnętrzach stworzono warunki dla fauny i flory żyjącej w kilku morskich środowiskach. Znajdują się w nim 71 zbiorników.