Na szczycie wysokiego wzgórza, ponad zabudową starego centrum Alwerni, wyrasta strzelista wieża oraz dachy kościoła i klasztoru Bernardynów. Ufundowane w 1616 r., starannie odnawiane i odbudowywane po pożarze w 2011 r. obiekty stanowią piękny przykład sztuki barokowej. Kościół uznawany jest za sanktuarium Pana Jezusa Miłosiernego, ponieważ przechowywany jest tu obraz Pana Jezusa Miłosiernego Ecce Homo. Wizerunek ten podobno był własnością ostatniego cesarza bizantyjskiego Konstantyna XI (1449–53), a do Alwerni trafił dopiero pod koniec XVII w. Sanktuarium jest drugim po Kalwarii Zebrzydowskiej miejscem w Małopolsce, w którym w Wielkim Tygodniu odgrywane jest Misterium Męki Pańskiej, z kolei w Boże Narodzenie można tu zobaczyć jasełka.