Pierwszy kościół w Wieliczkach powstał w 1552 roku i przez ponad 100 lat służył parafianom. W 1656 roku został spalony podczas najazdu tatarskiego, odbudowano go w ciągu dwóch lat, jednak już w 1674 roku został całkowicie zburzony przez huragan. Obecny kościół został wybudowany w 1676 roku z drewna modrzewiowego. Po II wojnie światowej został przejęty przez kościół rzymsko - katolicki i gruntownie wyremontowany. Obecnie należy do najstarszych kościołów drewnianych na Warmi i Mazurach.