Warto zwrócić uwagę na schody noszące nazwiska ofiarodawców, obraz św.Michała Archanioła w ołtarzu głównym, XVII-wieczny obraz św.Stanisława i jego relikwie. W świątyni znaleźć można też 3 wyeksponowane ślady krwi w metalowej tablicy oraz popiersia Jana Pawła II i ojca Augustyna Kordeckiego.
Będąc na Skałce koniecznie odwiedzić trzeba Kryptę Zasłużonych, w której spoczywają wybitni Polacy. Warto też nawiedzić sadzawkę św. Stanisława, w miejscu której, zgodnie z legendą, znaleziono porzucone zwłoki biskupa krakowskiego.