Od drugiej poł. XVIII w., a zwłaszcza po rozbiorach Polski, rozpoczynają się ograniczenia dla działalności domów zakonnych. Od roku 1778 objęły one Galicję (zabór austriacki), od 1810 Śląsk i Wielkopolskę, wreszcie po 1819 zabór rosyjski. Dziś można zatem spotkać w Polsce cystersów w 9 miejscach: Mogiła (Kraków), Szczyrzyc, Jędrzejów i Wąchock, Gdańsk – Oliwa, Henryków, Krzeszów, Trybsz i Sulejów. Na czele polskiej prowincji cystersów stoi tzw. opat.