Jej piękne wnętrze zostało zniszczone w czasie drugiej wojny światowej, a budynek używany był jako magazyn i stajnia dla koni. Niemieccy żołnierze pokryli również część budynku grubą warstwą farby. Po wojnie synagoga ponownie zaczęła pełnić funkcję religijną, ale już w latach siedemdziesiątych nabożeństwa odprawiano rzadko, a we wczesnych latach osiemdziesiątych praktycznie ich zaniechano. Jak wiele innych budynków na Kazimierzu, synagoga pozostawała w stanie zaniedbania i ruiny. Na szczęście dzięki renowacji budynek przywrócono do stanu phttps://youtu.be/ZU5En14C1A0rzedwojennego